UVECO
Induction
of microbial community responses and dissolved organic matter transformations
by UltraViolet radiation in marine ECOsytems
I. INTÉRÊT SCIENTIFIQUE (click to go to ...) | |
2. OBJECTIFS DU PROJET UVECO | |
> Objectif 1 : Étude des réponses cellulaires et moléculaires des populations microbiennes au stress UV | |
> Objectif 2 : Étude expérimentale de l'impact du rayonnement UV et du PAR sur la structure des composés organiques et sur son accessibilité par les bactéries marines | |
> Objectif 3 : Étude in-situ de l'impact du rayonnement UV sur les flux de carbone entre les compartiments MOD / bactéries / phytoplancton à la surface de l'océan. Modélisation des processus | |
> Objectif 4 : Impact du rayonnement UV sur les processus de dégradation biologique et photochimique du DMS et du DMSP | |
> Objectif 5 : Caractérisation de la pénétration du rayonnement UV dans le milieu marin | |
Sites d'étude retenus dans le projet UVECO (click to go to ..) | |
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Le
projet UVECO doit nous permettre d'étudier
certains processus bien précis mais également d'avoir une première estimation "quantitative" des
effets potentiels des UV sur la biologie et les transformations photochimiques
de la MOD. Nous avons fait le choix d'aborder l'impact du rayonnement
UV aux doses naturelles que nous rencontrons
actuellement. Il nous apparaît effectivement important de pouvoir estimer le
rôle des UV-R aux doses "naturelles" avant de pouvoir travailler
sur une simulation d'augmentation ou de diminution du rayonnement UV-B ou UV-A. |
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A) Étude des mécanismes
de photoadaptation des cyanobactéries marines Compte tenu de l’importance des cyanobactéries
marines, Synechococcus et plus encore Prochlorococcus,
dans la biomasse et la production chlorophyllienne des eaux superficielles
oligotrophes (Partensky et al., 1999), une question importante qui
se pose est leur capacité de résistance aux forts rayonnements de
photons visibles et UV-R incidents en surface de l’océan, et
l’impact de ces rayonnements sur la croissance et la photosynthèse
de ces cellules. Des expériences seront donc réalisées au
laboratoire puis sur le terrain pour évaluer la réponse des cellules
de Prochlorococcus et Synechococcus à une variété de
stress lumineux. Les effets induits par ces stress sur la
pigmentation seront étudiés grâce à deux techniques : l'HPLC pour
ce qui concerne les chlorophylles (et divinyl-chlorophylles) et les
caroténoïdes et une méthode spectrofluorimétrique (Lantoine and Neveux,
1999) pour ce qui concerne les phycobiliprotéines (essentiellement
phycoérythrine et phycocyanine). Pour les études in situ, le dosage
des caroténoïdes sera étendu à l’ensemble des pigments du phytoplancton,
avec une emphase particulière sur les pigments à rôle photoprotecteur.
Dans le cadre de ce projet, nous comptons également développer l'analyse
par HPLC des mycosporine like amino acids (MAAs), des composés induits
spécifiquement par le stress UV. Nous étudierons également les mécanismes
moléculaires mis en place par les cyanobactéries pour se protéger
contre l’excès de photons (visible ou UV-R). Les études seront
réalisées sur des souches de Prochlorococcus (MED4, une souche
de surface) et de Synechococcus (WH8102) dont les génomes
sont entièrement séquencés, rendant possibles des méthodes d'approche
globales de type protéomique. Ainsi, l’utilisation de l’électrophorèse
bidimensionnelle permettra de repérer l’ensemble des protéines
induites spécifiquement par différents types de stress lumineux (forte
lumière, UV-A et UV-B) puis de les séquencer et de les identifier
précisément grâce aux bases de données génomiques disponibles (voir
détails expérimentaux plus bas). En plus de cette approche globale,
nous nous intéresserons plus spécifiquement au rôle dans la photoprotection
des complexes zéaxanthine-protéine et des complexes pigments-HLIP
(high light inducible proteins) dans les membranes photosynthétiques
de Prochlorococcus et Synechococcus.
L’étude au laboratoire devrait révéler
l’identité d’un certain nombre de gènes importants dans
la photoprotection chez les cyanobactéries marines. Après avoir étudié leur
expression en conditions contrôlées, le même type d'études sera réalisé in
situ durant la campagne BIOSOPE. Nous nous intéresserons tout
particulièrement aux variations de l'expression survenant au cours
de la journée et/ou en fonction des conditions de milieu (profondeur,
couvert nuageux, niveau trophique). La partie centrale du Pacifique
Sud Est est particulièrement intéressante dans ce contexte car il
s'agit de la zone du globe la plus pauvre en particules et le coefficient
d'atténuation diffuse dans l'UV-R y est extrêmement faible. Autrement
dit, l'influence des UV-R doit se ressentir sur une couche relativement épaisse.
La faisabilité de la méthode de RT-PCR quantitative envisagée pour
l’étude de l’expression génique chez les populations
naturelles de Prochlorococcus a récemment été démontrée avec
un gène très faiblement exprimé (fstZ, codant pour une protéine
intervenant dans la multiplication cellulaire) dont l’expression
a été suivie au cours du rythme jour-nuit plusieurs jours consécutifs à la
station A dans le Golfe d’Aqaba (Holtzendorff et al., 2002).
L’un des buts de ce projet sera de distinguer l’effet
des fortes intensités visibles (PAR) seules et celles spécifiquement
dues au rayonnement UV.
B) Étude du spectre
d'action du rayonnement solaire et de la photoadaptation au stress
UV chez deux modèles de bactéries marines hétérotrophes
La connaissance précise du spectre d'action du rayonnement solaire
sur la physiologie des bactéries ainsi que des facteurs qui peuvent
le modifier sont des points importants dans l'estimation des conséquences
d'une modification du rayonnement UV à la surface des océans sur
le recyclage de la MOD par les bactéries. Les résultats de la littérature
sont assez divergents en ce qui concerne le rôle respectif des UV-B,
des UV-A et du PAR. Aas et al. (1996) ont observé que les UV-B, les UV-A
et le PAR contribuaient respectivement à 39%, 37% et 23% de l'inhibition
de la production bactérienne pour des eaux mésotrophes estuariennes.
Inversement, Sommuraga et al. (1997) ont observé que l'impact des
UV-B est négligeable et que les UV-A et le PAR ont un effet à peu
près égal dans l'inhibition de la production bactérienne dans le
cas de la Mer Adriatique. Nous avons nous mêmes observé des variations
notables dans l'inhibition bactérienne due aux différentes parties
du spectre solaire dans le cas d'un milieu côtier méditerranéen (travaux
du PNEC ART 5). Plusieurs raisons peuvent être évoquées pour expliquer
ces résultats contradictoires : (1) les protocoles expérimentaux
utilisés différent légèrement d'une étude à une autre (e.g., élimination
ou non de la communauté phytoplanctonique de l'échantillon; ajout
ou non du radioisotope durant l'incubation au soleil), (2) les communautés
bactériennes étudiées sont différentes (en termes de composition
et d'activité), (3) les conditions environnementales dans lesquelles
sont effectuées les expériences sont différentes (e.g., qualité et
quantité de MOD, limitations nutritives, température).
Afin de déterminer précisément le rôle des différentes longueurs
d'onde dans la réponse biologique, il est possible de décrire dans
des conditions contrôlées le Spectre d'Action Biologique (SAB; Spectral
Weigthing Function pour les auteurs anglo-saxons) (Neale, 2000).
Les SAB sont déterminés classiquement par l'utilisation d'une source
de lumière polychromatique et de filtres qui assurent des coupures
précises à une de longueur d'onde donnée (filtre passe-haut). Dans
ce schéma expérimental, les réponses biologiques mesurées reflètent
les effets simultanés (et parfois concurrentiels) de processus dépendants
de longueurs d'ondes multiples (Rundel, 1983). Un grand nombre des
travaux menés sur les SAB concerne des espèces phytoplanctoniques
(Neale, 2000). À notre connaissance, les seuls SAB réalisés sur des
bactéries marines concernent des bactéries chimiolithotrophes nitrifiantes
du genre Nitrosomas et Nitrococcus (Guerrero et Jones,
1996a,b). Les SAB des bactéries marines hétérotrophes restent encore
largement inexplorés. Dans le cadre du projet d'ATIPE SDU "Réponse des bactéries marines
au stress radiatif : rôle de l'environnement immédiat" (F. Joux),
nous étudierons le spectre d'action biologique du rayonnement solaire
sur deux modèles bactériens: Sphingomonas alaskensis RB2256
(alpha Protéobacterie, modèle de bactérie oligotrophe facultative)
et Vibrio angustum S14 (gamma Protéobactérie, modèle de bactérie
copiotrophe). Ce travail sera réalisé au moyen d'un simulateur solaire
en utilisant une lumière continue. Les paramètres étudiés recoupent
en grande partie ceux utilisés dans l'étude de la photoadapatation
de cyanobactéries marines décrite ci-dessus, notamment par l'utilisation
de l'approche protéomique (collaboration R. Cavichiolli). Il sera
donc possible d'effectuer des comparaisons intéressantes entre les
différents modèles étudiés. Ce travail, ainsi que le développement
des différentes approches méthodologiques seront effectués sur les
fonds propres au projet ATIPE.
Dans le cadre du projet UVECO, nous étendrons ce travail en étudiant
la réponse des deux modèles bactériens sous lumière modulée UV/visible
au moyen du cyclostat développé pour la culture des cyanobactéries
marines (cf. paragraphe 2.1.1.1). Ce dispositif offre des perspectives
de travail très intéressantes : il a été montré dans le milieu naturel
que l'activité des bactéries en surface et la quantité des dommages
ADN causés par les UV-B, suivaient un cycle jour/nuit bien marqué (activité minimale
et dommages maximals en fin de journée, activité maximale et dommages
minimals en début de matinée), suggérant un cycle inhibition/reprise
d'activité couplé à un cycle dommages/réparation (Jeffrey et al.,
1996; Visser et al., 2002). Il est assez difficile, malgré tout,
dans un contexte d'une communauté bactérienne complexe de faire la
part des choses entre les mécanismes actifs de reprise d'activité et
de réparation chez des cellules endommagées et l'élimination de ces
cellules par des prédateurs. Nous proposons dans le cadre d'UVECO, d'utiliser le cyclostat décrit
précédemment pour étudier la rythmicité de l'activité et des dommages
cellulaires chez les deux modèles de bactéries du projet ATIPE. Ce
dispositif doit également nous permettre de mettre en évidence si
les bactéries peuvent développer des mécanismes de photoadaptation
au stress UV. Celui-ci a déjà été observé chez une espèce de Vibrio soumis
au stress UV-B et se traduisait par une induction moindre de dimère
de thymine lors d'une deuxième exposition aux UV-B après une phase
de réparation (Joux et al., 1999). Les différentes approches méthodologiques
développées dans le cadre de l'ATIPE seront utilisées pour cette étude
spécifique du projet UVECO.
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A) Impact du rayonnement UV et PAR sur
la dégradation des acides gras, des polysaccharides et des protéines
Des études
récentes ont montré que la dégradation photochimique de la MOD pouvait jouer
un rôle très important dans le cycle du carbone par l’intermédiaire de deux
processus : (1) Un processus abiotique conduisant à une production photochimique
directe de CO (Mopper et al., 1991) et de CO2 (Granéli et al.,
1996), et (2) un processus séquentiel photochimie/voie biotique impliquant
une photodégradation de la MOD suivie d’une assimilation bactérienne et d’une
transformation en biomasse et en CO2 par respiration. Par ailleurs
de nombreux travaux suggèrent que la réponse du bactérioplancton en présence
de MOD exposée aux UVB-R est fonction de son origine et de sa composition
avant et après l’exposition (Naganuma et al., 1996 ; Mopper et Kieber,
2000 ; Obernosterer et al. 2001). D’autre part, l’activité bactérienne
peut-être inhibée par la production photochimique de radicaux libres (Qian
et al., 2001). Les UVB-R ne conduisent
pas seulement à une dégradation de la MOD mère, mais induisent également
des réactions secondaires par l’intermédiaire de photosensibilisateurs, réagissant
avec des molécules qui n’absorbent pas les UV-R. Il
s'agira de déterminer, en condition de laboratoire et dans la permière partie
de ce travail, si le rayonnement
UV-R et le PAR est un facteur essentiel à la photodégradation ou la photoaltération
de la MOD.
Nos
objectifs abordés dans ce thème de recherche seront d’étudier les effets
du rayonnement UV sur : - Les modifications de la structure
physico-chimique de la Matière Organique Dissoute Colorée (MODC) induites par
les irradiations seront suivies par les spectres d'émission et
d'excitation intégrés sous formes de matrices 3D (contouring),et par la composition de
la MODC
quantifiée en chromatographie d'exclusion de tailles (SEC-Chromatographie)
(Minor et al., 2002).
- La production
de molécules à courtes chaîne comme les acides dicarboxyliques, les céto-acides à partir
d’acides gras mono-insaturés ex : l’acide oléique) pour différentes
dosses d’irradiation UV-R (A, B) et de PAR.
- La production
d’acides aminés à partir de différentes protéines et de peptides pour différentes
doses d’irradiation UV-R (A et B) et de PAR.
- La production
de monosaccharides à partir de différents polysaccharides et oligosaccharides
pour différentes doses d’irradiation UV-R (A et B) et de PAR.
- Ces expériences
seront réalisées sur des molécules synthétiques et naturelles en solution
dans l’eau de mer et dans de l’eau ultra-pure. Le rôle des photosensibilsateurs
comme les radicaux OH. produits par exemple à partir des nitrates
sera également abordée dans ces travaux.
B) Dégradation
des composants lipidiques du phytoplancton par le rayonnement UV et PAR
Lors
de la sénescence du phytoplancton, l’énergie lumineuse captée par la chlorophylle
n’est plus utilisée dans les réactions photosynthétiques (Nelson, 1993).
Ceci conduit à un afflux de formes excitées de la chlorophylle et de l’oxygène
qui sature alors les systèmes photoprotecteurs des cellules (caroténoïdes,
vitamine E …) (Merzlyak et Hendry, 1994). Il en résulte une
photodégradation intense de nombreux constituants cellulaires (chlorophylles,
stérols, acides gras insaturés, alcènes) (Rontani et al., 1995 ; 1997 ;
1998 ; Rontani, 2001 ; Mouzdahir et al., 2001a). Contrairement à certaines
idées reçues, cette dégradation n’est pas induite par les radiations les
plus énergétiques (UV) mais par les radiations du domaine du visible responsables
de la photosynthèse (PAR, Photosynthetically Active Radiation). Ces réactions
photochimiques conduisent à la formation de nombreux hydropéroxydes. Lors
de l’analyse de divers échantillons de matériel particulaire et de sédiments
récents, nous avons pu mettre en évidence des quantités importantes de ces
composés (Rontani et Marchand, 2000 ; Marchand et Rontani, 2001), pourtant
généralement considérés comme très instables. Ces hydropéroxydes d’origine
photochimique sont susceptibles d’induire diverses réactions radicalaires
(autoxydation) et donc de jouer un rôle non-négligeable lors de la diagenèse
de la matière organique phytoplanctonique en zones oxiques (colonne d’eau
et couche superficielle des sédiments).
Nos
objectifs abordés dans ce thème de recherche seront d’étudier l’effet
des radiations UV et visibles sur les composants lipidiques (acides gras
insaturés, stérols, chaîne phytyle des chlorophylles) des cellules phytoplanctoniques
(cinétiques de dégradation et identification des photoproduits) afin de rechercher
ensuite les composés formés in situ et de déterminer le rôle réel
joué par ces deux types de radiations dans la dégradation de la MOP.
C) Impact du rayonnement
UV et PAR sur le recyclage bactérien de la matière organique
Ce
type de travaux portera sur :
-
Les effets des modifications (dues à différentes intensités d’exposition) des
structures moléculaires des acides gras, des protéines et des polysaccharides
sur l’activité de dégradation bactérienne en terme de vitesse de dégradation,
d’activité enzymatique et de rendements de croissance bactérien (Sempéré et
al., 1998; 2000; 2002; Panagiotopoulos et al., 2002).
-
Les effets des dommages bactériens (dues à différentes intensités d’exposition)
seront estimés d’une part par le suivi de la protéine RecA (caractéristique
du stress UV dans la cellule bactérienne) et par des mesures de production
bactérienne durant les processus de dégradation ultérieurs. Nous étudierons
ensuite l’impact des dommages bactériens sur l’activité de dégradation bactérienne
de composés organiques (protéines, polysaccharides et acides gras) en terme
de vitesse de dégradation, d’activité enzymatique et de rendements de croissance
bactérien.
Ces
expériences seront réalisées au LMM-COM Marseille à partir de souches bactériennes
marines et de molécules synthétiques exposées à différentes doses de rayonnement
UV (A et B) et de PAR. Le rôle des photosensibilisateurs sera également étudié dans
ce type de recherche. Ces études seront ensuite abordées à partir d’échantillons
naturels. Il
est important de noter que ces travaux seront poursuivis à partir de solutions
naturelles marines (en terme d’assemblage bactérien et de composés organiques)
dans l’objectif 3 de ce programme et durant la participation du groupe "UVECO" aux
projets de campagnes océanographiques hauturières Biosope, Keops et Action
(PROOF) dans lequel notre groupe est engagé à participer.
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Différents effets liés au rayonnement UV sur le phytoplancton,
les bactéries et la matière organique dissoute ont été décrits dans
la littérature comme pouvant affecter les flux de carbone entre ces
compartiments. Ces effets n'ont jamais été étudiés simultanément, par
conséquent il est impossible de pouvoir apprécier l'importance de chacun
d'entre eux et d'avoir une vision synoptique des modifications de flux
de carbone résultant de l'exposition au rayonnement UV.
Les
principaux processus susceptibles d'être affectés par le rayonnement
UV sont les suivants :
-
production primaire
-
variations des paramètres photosynthétiques
-
excrétion phytoplanctonique
-
production bactérienne
-
activité bactérienne exoenzymatique
-
rendement de croissance bactérien
-
photo-oxydation directe de la MOD
-
accessibilité de la MOD à la dégradation bactérienne
Le
premier challenge de cet objectif est d'étudier ces différents effets (en distinguant ceux liés
aux UV-B et ceux liés aux UV-A) d'une manière conjointe sur des échantillons
en Méditerranée. L'autre challenge est de réaliser ces mesures à différentes
profondeurs dans la colonne d'eau. Effectivement, la plupart des études
concernant l'impact du rayonnement UV ont été réalisées en utilisant
des incubations en surface et/ou en laboratoire. Il est très difficile
d'apprécier à partir de ces seules expériences l'ampleur des effets étudiés
dans la colonne d'eau en raison de la modification de la composition
du rayonnement solaire en fonction de la profondeur. L'approche utilisée
permettra d'avoir une vision intégrative des effets mesurés qui est
essentielle si l'on veut apprécier correctement l'impact des UV sur
le fonctionnement du réseau trophique microbien. L'autre point original
de ce travail sera de quantifier l'effet négatif du rayonnement UV
sur la production primaire en fonction de la classe de taille du phytoplancton.
Si quelques mesures ont déjà été réalisées dans le cas de systèmes
lacustres, aucune donnée n'existe à notre connaissance sur l'environnement
marin. Les différentes classes de phytoplancton étant consommées par
différents types de prédateurs, cette donnée est importante à connaître
pour apprécier l'impact des UV sur le transfert de la biomasse phytoplanctonique
vers les échelons supérieurs. Un premier atelier aura lieu à Banyuls
durant l'été 2004, qui permettra de rôder le système en réalisant 3
séries d'expériences sur des journées différentes. Durant la campagne
en Méditerranée programmée en été 2005, le dispositif sera utilisé pour
réaliser 4 à 5 séries d'expériences le long du transect allant de 5° à 30° E.
Les résultats obtenus serviront à l'établissement d'un modèle où le
forçage des UV sera identifié en fonction de la profondeur dans la
colonne d'eau (collaboration F. Touratier, CEFREM). Ce modèle, qui
n'a pas été réalisé pour un système aquatique, pourra constituer une
première étape car le facteur d'atténuation des dommages par le mélange
des masses d'eau ne sera pas pris en compte (les incubations d'échantillons étant
réalisées à profondeurs fixes). La réalisation de ce objectif devrait
profiter du concours de W. Jeffrey durant l'atelier Banyuls 2004. Un
poste rouge CNRS sera demandé pour ce chercheur américain spécialisé dans
l'étude de l'impact du rayonnement UV sur les bactéries marines.
Un apport non négligeable des études de processus que nous mènerons en milieu naturel sera d'estimer l'erreur introduite par les méthodologies classiques de mesures d'activité biologique. Nos résultats obtenus dans le cadre d'un projet du PNEC ART 5 montrent une inhibition importante en surface de la production primaire et bactérienne par les rayonnements UV. La production primaire est généralement mesurée après inoculation de 14C et incubation dans des flacons en polycarbonate transparents, alors que la production bactérienne est mesurée à l'obscurité. L'utilisation de telles conditions d'incubation filtrant une partie importante ou la totalité des rayonnements UV pourrait introduire une surestimation importante des quantités de carbone fixé et recyclé sur la colonne d'eau, particulièrement dans les zones superficielles.
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S'il
se confirme que les processus de production et de destruction des composés
soufrés DMSP et DMS sont particulièrement sensibles au rayonnement
UV-A, comme semblent l'indiquer les travaux préliminaires sur le sujet,
un changement du rayonnement UV-A induit par un changement de la nébulosité et
des propriétés radiatives des nuages pourrait avoir un impact important
sur le cycle biogéochimique de ces composés. Les conclusions de nos
travaux qui ont porté sur l'impact de l'augmentation de l'effet de
serre sur les apports de sulfure de diméthyle (DMS) à l'atmosphère
(Bopp et al., 2002) et sur la rétroaction du DMS sur le bilan radiatif via l'effet
indirect qu'exerce le DMS sur les propriétés radiatives des nuages
(Bopp et al., soumis), pourraient en être affectées.
Nous
avons choisi dans le cadre du projet UVECO de nous focaliser sur
les processus de photolyse du DMS et de dégradation du DMSP par les bactéries
hétérotrophes.
Nous étudierons
plus précisément dans le cadre du projet UVECO :
-
le rôle de la qualité de la DOM dans le processus de photolyse du
DMS,
-
le rôle potentiel de la prise de DMSP par les bactéries dans leur
résistance au stress UV et dans leur capacité de récupération après exposition
au stress UV.
-
et l'importance relative des processus de photolyse et de dégradation
bactérienne du DMS dans la colonne d'eau. |
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La profondeur de pénétration des UV dans la colonne d’eau peut-être évaluée à l’échelle globale, en combinant les estimations satellitales d’éclairement UV à la surface de l’océan (satellite TOMS) calculées en fonction de l’angle solaire au zénith, des quantités d’ozone et d’aérosols, de l’albédo de surface, de la nébulosité et des estimations satellitales de la couleur de l’océan (satellite SeaWIFS) dans la région spectral du visible (Madronich, 1993 ; Herman et al., 1998 ; Moran et Zepp, 2000 ; Vasilkov et al., 2001). La nébulosité et les aérosols ont des effets importants sur la transmission des radiations UV (Green et Schippnick, 1982 ; Madronich et al., 1998 ; Herman et al., 1998) mais apparaissent moins sélectifs que l’ozone, affectant aussi les UVA-R et le domaine visible.
Un des objectifs de ce projet sera de préciser la profondeur
de pénétration du rayonnement UV en Mer Méditerranée par des mesures
de rayonnement in situ à l'aide d’un radiomètre en relation avec les
concentrations de COD, de CDOM, de chlorophylle a et de MES.
Des données d’irradiance UV pourront être obtenues également durant
les campagnes hauturières auxquelles le groupe UVECO est engagé (programmes
Biosope, Keops, Action). Elles seront comparées et serviront à calibrer
les estimations satellitales obtenues à partir du sattelite TOMS (négociations
en cours avec A. Vasilkov). |
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Le
domaine d'investigation prévilégié dans
ce projet sera la Méditerranée pour des raisons de stratégie de recherche
: nous souhaitons dans un premier temps avoir un accès rapide à des échantillons
pour mener différentes expériences in situ et au laboratoire
qui demandent pour certaines d'entres elles quelques mises au point.
Cette facilité d'accès aux échantillons nous permettra également de
prendre en considération la variabilité temporelle dans les réponses
mesurées qui est trop souvent négligée dans les études sur l'impact
du rayonnement UV. Ce travail reposera notamment sur l'utilisation
des données de stations d'observation sur lesquelles nous travaillerons. La mer Méditerranée constitue
un milieu oligotrophe exposé à des doses relativement élevées d'UV
du fait de la faible couverture nuageuse (Vasilkov et al., 2001). En
dépit du fait que les doses naturelles en UV des zones méditerranéennes
peuvent excéder celles des hautes latitudes, même celles sous l'influence
de la diminution de la couche d'ozone, très peu de choses sont connues
sur l'impact des UV sur les communautés bactériennes et phytoplanctoniques
en Méditerranée ainsi que sur l'importance des processus de phototransformations
de la MOD.
1) Banyuls/mer
: La position géographique
et les moyens à la mer (R/V Néréis II) du Laboratoire Arago, permettent
d'échantillonner durant la journée des types d'eaux avec des caractéristiques
assez tranchées avec des eaux typiquement côtières et des eaux relativement
oligotrophes. Ce site d'étude bénéficie du service d'observation
de la station côtière SOLA (Lat.: 42°29'N; Long.: 3°08'E) (réseau
du SOMLIT) qui enregistre un certain nombre de paramètres météorologiques,
chimiques et biologiques (http://ww2.obs-banyuls.fr/sola/sola.html).
Le Laboratoire Arago est également équipé d'un radiomètre terrestre
qui assure l'enregistrement en continu du rayonnement UV-B, UV-A
et PAR. Cette installation fait partie du réseau ELDONET qui compte
une vingtaine de stations de mesures en Europe (http://www.eldonet.org/).
2) Marseille : La position géographique
et les moyens à la mer (R/V Antédon) du COM, permettent d'échantillonner
durant la journée des types d'eaux avec des caractéristiques assez
tranchées avec des eaux typiquement côtières (station SOFI) et des
eaux sous influence anthropique et plus riches en MOD (station SOFCOm).
Ce type d’étude bénéficiera de collaborations établies avec le conseil
général de la région PACA (bourse de thèse 2002-2005 acquise pour Marc
Tedetti, LMM) ainsi que les sociétés locales Airmarex et ACRI. Ces
collaborations impliquent des mesures régulières d’irradiance UV-visible
dans la zone côtière de Marseille couplées à des mesures d’ozone troposphérique
(Airmarex, Marseille) et des mesures d’estimations du rayonnement UV à partir
de données satellitales et d’algorithmes (Société ACRI, région PACA).
3) Transect Méditerranée
occidentale-orientale : campagne UVECO/ACTION Une demande de campagne en Méditerranée sur le R/V Thalassa sera
formulée pour l'été 2005. Cette demande se fera en association avec
l'équipe du projet ACTION (programme PROOF, resp. C. Goyet). Cette
campagne d'une durée de 4 semaines, couvrira un transect des longitudes
5° E aux longitudes 30° E.
Certains participants au projet
UVECO feront également partie de différentes campagnes (sous réserve
d'acceptation des projets) dans lesquelles la problématique UV pourra être
abordée, notamment par des mesures de pénétration du rayonnement UV
en mer :
-
CADO dans l'Océan Antarctique (zone couverte :
Secteur Indien Antarctique : trajet Ile de la Réunion-Base Dumont-Durville)
(LMM; février 2003),
-
PROOF-BIOSOPE dans le Pacifique sud Est (resp.
H. Claustre), (LMM, SBR; fin 2003-début 2004),
-
PROOF-KEOPS dans l'Océan austral (resp. S. Blain)
(LMM; Hiver 2003-2004 ; zone d’étude : plateau de Kerguelen).
Pacifique Sud-Est :
Les eaux ultra-oligotrophes qui seront traversées lors du transect
le long d’une radiale Est-Ouest à 27°S prévu dans le cadre de la campagne
BIOSOPE (programme PROOF, resp. H. Claustre programmée fin 2004-début
2005) constitueront une autre source intéressante d’échantillons pour
tester l’effet du rayonnement ultra-violet sur les différents paramètres
géochimiques et biologiques qui mesurés dans le cadre du présent programme.
En particulier, il est prévu d’étudier jusqu’à quelle profondeur le
stress UV est sensible dans de telles conditions de transparence de
l’eau pour les picocyanobactéries marines (notamment Prochlorococcus qui
est un composant majeur de cet écosystème) en étudiant l’expression
de gènes spécifiquement induits par ce stress.
Durant cette campagne des mesures d’irradiances UV-Visible
seront effectuées à l’aide d’un radiomètre (submersible et de surface)
associées à des mesures de carbone organique dissous, de CDOM, de
chlorophylle a et
de MES. Une collaboration (en cours de négociation avec le Dr. Vasilkov)
devrait permettre un calibrage des données satellites (en particulier
une estimation de la pénétration du rayonnement UV dans la colonne
d’eau à partir de données satellitales atmosphériques comme la concentration
en ozone, et la nébulosité). Durant cette campagne des expériences
de biodégradation de MOD exposée aux UV-R seront également réalisées.
Océan austral (campagne
KEOPS) : Des mesures de rayonnement UV ainsi que des facteurs influant
sur la pénétration des UV-R seront également réalisées la campagne
KEOPS (programme PROOF, resp. S. Blain, fin 2003-2005), et probablement
CADO (conditions soumise à l’obtention ou au prêt d’un radiomètre).
Des expériences visant à étudier l’impact du rayonnement UV-visible
sur le recyclage bactérien de la matière organique dissoute seront
effectuées durant les missions KEOPS et CADO. Ces expériences seront
réalisées à partir d’échantillons naturels prélevés durant les campagnes
et incubés suivant différents types de rayonnement (à l’aide de filtres
et de tubes en quartz et en Pyrex) durant la campagne. |
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8 février, 2008
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