PECHE : Liste des publications

                                                   nov. 27, 2007

 

 

** : fichier pdf en accès public  (   ) à la rubrique PROJECT LIFE \ Posters

* : fichier pdf en accès restreint (   ) à la rubrique BIBLIOGRAPHY \ Master Reports

 

 

 

 

Agis M., A. Granda 1, J.R. Dolan 2007 A cautionary note: Examples of possible microbial community dynamics in dilution grazing experiments Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 341 (2007) 176–183

 

Dolan, J.R. and K. McKeon. 2005. The reliability of grazing rate estimates from dilution experiments: Have we over-estimated rates of organic carbon consumption? Ocean Science 1: 1-7.

 

Goutx M . , B. Moriceau, C. Lee, Z. Liu, C. Guigue, M. Duflos, M. Tedetti, R. Sempere, S. G. Wakeham, and J. Xue 2007 Composition and degradation of marine particles with different settling velocities, Limnology and Oceanography , 52(4), 1645–1664.

 

Ghiglione J.F., G. Mevel, M. Pujo-Pay, P. Lebaron et M. Goutx. 2007. Diel and seasonal variations in abundance, production and community structure of particle-attached and free-living bacteria in offshore NW Mediterranean water column. Microbial Ecology , http://dx.doi.org/10.1007/s00248-006-9189-7

 

Nedoma J, Van Wambeke F, Strojsova A, Strojsova M and Duhamel S. 2007 An alternative way to determine the affinity of extracellular phosphatases for ELF97 phosphate in aquatic environments. Marine and Freshwater Research 58 (5) 454-460.

En révision ou soumises

Bourguet N., Ghiglione, J.F., Pujo-Pay Mireille, Mevel G., Momzikoff A., Guigue C., Fuda J. L., Garcia, N., Raimbault, Pete R., Lefèvre D.,and M. Goutx . Relationship between organic matter composition and bacterial dynamics during mesotrophic and oligotrophic conditions in the NW Mediterranean Sea, ( submitted DSR2)

 

Marty J.C., Garcia N., Raimbault P. Phytoplankton dynamics and primary production in destratification conditions (DYNAPROC II cruise Sep./Oct. 2004, NW Mediterranean Sea) (in revision DSR1)

 

 

 

 

Pocho, C., Prieur, L. & V. Andersen, 2004. Fascicule COPIEPLOT de DYNAPROC 2 (Graphiques Seasave des données CTD brutes). Fichier PDF. 256 pp.  

 

 

3.1 Communications orales

 

 

Andersen, V., André, M., Gubanova, A., Altukhov, D., Khvorov, S., Tsarin, S., Picheral, M., Prieur, L. & L. Mousseau, 2006. Short-term changes in the zooplankton community during the summer-autumn transition in the open NW Mediterranean. 38th International Liège Colloquium on Ocean Dynamics, “Revisiting the Role of Zooplankton in Pelagic Ecosystems”, 8-12 mai 2006, Liège.

 

Dolan, J R. 2005 . Dilution: use results with caution. ASLO 2005 Aquatic Sciences Meeting, Salt Lake City, Utah, USA. Feb 20 -25, 2005.

 

Ghiglione J.F., G. Mevel, M. Pujo-Pay, P. Lebaron, M. Goutx 2007 Diel and seasonal variations in abundance, activity and community structure of particle-attached and free-living bacteria in NW Mediterranean Sea (0-1000m), 38th CIESM Congress - Istanbul, Turkey, 9-13 April,

 

Ghiglione JF, Mevel G, Pujo-Pay M, Goutx M 2007 . Role of particle-attached bacteria in the microbial loop: example of the NW Mediterranean Sea, 10th Symposium of Aquatic Microbial Ecology (SAME-10), FARO, Portugal,September 1-7.

 

Goutx, M., Moriceau B., Guigue C., Pete R., Lee, C., Armstrong, R., Wakeham, S.G., Peterson, M.L. 2004 . MedFlux : biodegradability of large particles of different sinking velocities. 37 th CIESM congress, Barcelone, 7-12 Juin 2004.

 

Goutx, M., Sempéré, R., Lee, C., Armstrong, R., Liu, Z., Guigue, C., Duflos, Moriceau, B., Wakeham, S. G , Peterson, M., 2005. Composition and degradation of sinking particles with different settling velocities. ASLO, 24-30 Juin 2005, Santiago de Compostelle, Espagne.

 

Lasternas S, Tunin-Ley A, Ibanez F, Andersen V, Pizay V., Pizay MD & Lemée R (2007). Diel vertical abundance and diversity of microphytoplankton in NW Mediterranean Sea (DYNAPROC II Cruise ; Sep-Oct 2004). ASLO, April 2007, Santa Fe, USA.

 

Lee, C., Armstrong, R.A., Wakeham, S.G., Cochran, J.K., Miquel, J.C., Masqué, P., Goutx, M., 2004. Medflux: association of orga nic matter with ballast minerals in sinking particles, ASLO, 14-20 Février 2004, Honolulu, Hawai.

 

Miquel, J.C., Toubal, T., Rodriguez y Baena, A., Daudey, D., Schmidt, S. & V. Andersen, 2006 . C and 234 Th downward fluxes through the twilight zone; a multi-depth sediment trap study in the NW Mediterranean Sea (DYNAPROC-2). ASLO Ocean Sciences Meeting, 20-24 Février 2006, Honolulu, Hawaii, OS24H-01.

 

Mousseau, L., Lefèvre, D., Andersen, V., Narcy, F. & P. Nival, 2006 . Role of the zooplankton community composition on the mineralisation and the vertical flux of organic matter at a fixed station in the Ligurian Sea. 38th International Liège Colloquium on Ocean Dynamics, “Revisiting the Role of Zooplankton in Pelagic Ecosystems”, 8-12 mai 2006, Liège

 

Van Wambeke, F., Nedoma, J., Duhamed, S., Strojsova A., Moutin, T., Garcia N. & M. Goutx, 2006 . Phosphatase Activity of Heterotrophic Bacteria at Single Cell Level. First Assays in Mediterranean Sea and on Marine Bacterial Cultures. ASLO Ocean Sciences Meeting, 20-24 Février 2006, Honolulu, Hawaii

 

 

3.2 Posters

Andersen, V. & M. Goutx, 2003. Production and Exportation of Carbon: control by HEterotrophic organisms at small time scales (PECHE). OCEANS, Ocean biogeochemistry and Ecosystems Analysis - International Open Science Conference, Paris, 7-10 janvier 2003, Program and Abstracts, p. 56.

 

Andersen V. & M. Goutx, 2003. Projet PECHE. Production et Exportation du Carbone : contrôle par les organismes Hétérotrophes à petite échelle de temps. Comité d'évaluation du LOV, 14-15 Octobre, Villefranche-sur-Mer.

 

Ghiglione, J.F., Mével, G., Pujo-Pay, M., Lebaron, P. & M. Goutx 2005 . Diel and seasonal variations in abundance, production and community structure of free-living and particle-attached bacteria in NW Mediterranean water column (0-1000m). The 9th Symposium on Aquatic Microbial Ecology (SAME 9), 21-26 Août 2005, Helsinki (Finlande).

 

 Goutx, M. Bourguet, N., Guigue, C., Ghiglione, J.F. Pujo-Pay, M., Mével, G. Momzikoff, A. Raimbault, P., Lefèvre, D., Andersen, V., 2005. Bacterial activities and community structure interactions with organic matter dynamics at diel scale and during seasonal stratification in the NW Mediterranean. EGS, 24-28 Avril 2005, Vienne, Autriche.

 

 

 

4.1 Communications orales

Andersen, V. & M. Goutx . Projet PECHE. Colloque de restitution PROOF 2002-2005, Toulouse, 18-20 mai 2005.

 

Andersen V. , 2005. PECHE-DYNAPROC, premiers résultats. Séminaire annuel du Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, Nice, 28 novembre 2005.

 

Bourguet N., Goutx M., Pete R., Mevel G., Ghiglione J.F., Pujo-Pay M., Lefèvre D. 2004. Ectoenzymatic activities and carbon fluxes at DYFAMED during the ProPeche 1 & 2 cruises : Focus on lipids / lipase relationships. Atelier international, Programme MedFlux, NSF-CNRS, Marseille 1-4 Juin 2004

 

Ghiglione J.F, Mével G., Lebaron P. and Goutx M. Suivi saisonnier de la structure des communautés bactériennes libres et attachées aux particules entre 0-1000 m en Mer Méditerranée. 2ème Colloque d'Ecologie Microbienne, Obernai, 9-12 Mai 2005.

 

Goutx, M., Jeandel, C., Miquel, J.C. 2006. Flux d'Exportation en Méditerranée Nord Occidentale (Campagne Barmed, Dyfbal, Propeche)- CIRMED UPS 850, 19-20 Janvier 2006, Compte rendu du colloque quadriennal de restitution du CIRMED. p. 24-25.

 

Raybaud, V., Andersen, V., Nival, P., Prieur, L., 2006. Control of carbon production and export to depth by zooplankton organisms and episodic events: a trophic food-web modelling approach. 5th Green Ocean Workshop, Villefranche-sur-Mer, 10-12 avril 2006.

 

Raybaud, V., Andersen, V., Nival, P., Prieur, L., 2006. Approche par modélisation  de l'évolution de l'écosystème pélagique  observé pendant la campagne Dynaproc 2. Séminaire annuel du LOV, Nice, 20 novembre 2006.

 

 Raybaud, V., Andersen, V., Nival, P., 2007. Approche par modélisation  de l'évolution de l'écosystème pélagique  observé pendant la campagne Dynaproc 2. Journées LOB-LOV-COMORE, Villefranche-sur-Mer et Sophia-Antipolis les 27 et 28 mars 2007.

 

 

 

- La Belle Bleue n°76, France 3 Méditerranée, 4 décembre 2004

- Page d'actualités sur le site de l'Observatoire de Villefranche, janvier 2005

(http://www.obs-vlfr.fr/Actualites/janvier-2005/dynaproc2.php)

 

 

 

 

Bourguet, Nicolas, 2005. Rôle de l'activité hydrolytique bactérienne dans le cycle de la matière organique en milieu marin : focus sur les enzymes lipases. Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé, discipline Microbiologie, Biologie Végétale et Biotechnologies, Université de la Méditerranée (M. Goutx, LMGEM, Marseille).

 

Duflos, Marie, (M. Goutx et F. Van Wambeke, LMGEM, Marseille)(soutenance prévue en Novembre 2008). Activité lipase en milieu marin naturel et anthropisé: impact biogéochimique. Université de la Méditerranée (M. Goutx et F. Van Wambeke , LMGEM, Marseille).

 

Duhamel, Solange, 2007. Compétition entre bactéries hétérotrophes et producteurs primaires pour la ressource nutritive limitante en milieu océanique oligotrophe : couplage des flux de carbone et de phosphate en relation avec la structure fonctionnelle des communautés. (F. Van Wambeke, LMGEM, et Thierry Moutin, LOB, Marseille) (thèse soutenue en Novembre 2007; 30% Peche)

 

Raybaud, Virginie. Contrôle de la production primaire et de l'exportation du carbone en profondeur par les organismes zooplanctoniques et les perturbations impulsionnelles. Thèse de Doctorat de l'Université Paris VI, Mention “Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie”, Spécialité “Océanographie et Environnement Marins” (V. Andersen, LOV, Villefranche-sur-Mer). (thèse commencée en octobre 2005 ; 80% Peche)

 

Tunin, Alina. Impact du changement climatique et des apports anthropiques sur la diversité spécifique des producteurs primaires (microphytoplancton) en Méditerranée nord-occidentale. Ecole doctorale (ED 129) des Sciences de l'Environnement d'Ile de France. Option Océanologie Biologique et Environnement Marin. Université Paris VI (F. Ibanez et R. Lemée, LOV, Villefranche-sur-Mer) (thèse commencée en octobre 2004 ; 15% Peche)

 

 

7.1 DEA et Master 2^e année

 

André, Martial, 2005. Diversité structurelle et fonctionnelle de la communauté zooplanctonique en période de transition saisonnière en Méditerranée nord-occidentale. Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (V. Andersen, LOV, Villefranche-sur-Mer).

 

Aritio, Diégo, 2005. Dynamique de la fraction lipidique dissoute en Méditerranée nord occidentale lors de la fin de la stratification estivale. Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (M. Goutx, LMGEM, Marseille).

 

Daudey, Delphine, 2005. Suivi à haute résolution temporelle des flux de carbone dans la colonne d'eau pendant la campagne Dynaproc 2. Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (J.C. Miquel, AIEA, Monaco).

 

El Asri, Halima, 2005. Matière Organique Dissoute Colorée (MODC) dans la colonne d'eau au Point Central de la campagne Dynaproc 2 en période de transition saisonnière (Site DYFAMED). Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (A. Momzikoff, LOCEAN, Paris).

 

Hermant, Enrick, 2005. Etude des flux de biomarqueurs moléculaires phytoplanctoniques. Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (L. Méjanelle, LOCEAN, Paris).

 

Lasternas, Sébastien, 2005. Influence des événements climatiques épisodiques (coups de vent) sur la composition et la dynamique du microphytoplancton en Méditerranée nord-ocidentale (Mission Dynaproc 2). Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI. (R. Lemée, LOV, Villefranche-sur-Mer).

 

Mauriac, R. 2007 . Activités ectoenzymatiques et facteurs limitant l'activité hétérotrophes des bactéries à Dynaproc 2 (F. Van Wambeke, LMGEM,Marseille).

 

Narcy, Fanny, 2005. Rôle du zooplancton dans les flux de matière organique à une station fixe en mer Ligure. Master 2e année Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie; Spécialité Océanographie et Environnements marins, Université Paris VI (L. Mousseau, LOV, Villefranche-sur-Mer, et D. Lefèvre, LMGEM, Marseille).

 

Pete, Roman, 2003. Rôle des agrégats marins dans l'exportation de matière organique en Mer Ligure : Approche par l'étude de la fraction lipidique et de sa biodégradabilité. DEA Sciences de l'Environnement Marin, Université de la Méditerranée (M. Goutx, LMGEM, Marseille).

 

Ras, Monique, 2003. Mise au point et validation d'une technique de marquage de l'activité phosphatase alcaline au niveau cellulaire chez les bactéries marines, DEA Sciences de l'Environnement Marin, Université de la Méditerranée (F. Van Wambeke, LMGEM, Marseille).

 

Séguret, Marie, 2003. Reminéralisation et exportation de la matière organique par le zooplancton en mer Ligure. DEA Sciences de l'Environnement Marin, Université de la Méditerranée (L. Mousseau, LOV, Villefranche-sur-Mer, et D. Lefèvre, LMGEM, Marseille).

 

Tavernier, Cindy, 2005 Variation à court terme de la distribution verticale de l'ultraphytoplancton en Méditerranée (campagne DYNAPROC 2, 13 septembre-18 octobre 2004). Master recherche Biodiversité, Paléontologie, Océanologie Biologique, Université des Sciences et Techniques de Lille (M. Denis, LMGEM, Marseille).

 

 

7.2 Maîtrise ou Master 1^e année

 

Auffret, Marc, 2005. Relation structure/fonction des communautés bactériennes libres et attachées aux particules en Mer Méditerranée. Stage de Master 1ère année, Université Paris VI (J.-F. Ghiglione, LOBB, Banyuls/mer).

 

Harmel, Tristan, 2005. Etude des échanges océan-atmosphère aux petites échelles de temps en mer Ligure pendant la période automnale (campagne DYNAPROC 2). Impacts sur l'évolution de la colonne d'eau. Master 1ère année, Sciences de l'univers, Environnement, Ecologie; Spécialité: Océan Atmosphère Climat et Détection, Université Paris VI (L. Prieur, LOV, Villefranche-sur-Mer).

 

Knockaert, Anne, 2003. Flux biologiques de CO2 : production et respiration. Maîtrise de Biologie des Populations et des Ecosystèmes Marins, Université de la Méditerranée (D. Lefèvre, LMGEM, Marseille).

 

Marceau, Nicolas, 2006 . Etude de l'activité phosphatase alcaline au niveau cellulaire chez les bactéries marines en relation avec la diversité bactérienne. Application à la campagne océanographique DYNAPROC 2. Stage, Ecole Supérieure d'Ingénieur de Luminy (F. Van Wambeke, LMGEM, Marseille).

 

Triana, Elisa, 2005. Dynamique du flux particulaire dans la colonne d'eau océanique, étudiée par les hydrocarbures. Master 1 ère année, Mention Sciences de l'Univers, Environnement et Ecologie, Spécialité EBE, Université Paris VI (I. Bouloubassi & L. Méjanelle, LOCEAN, Paris).

 

Noirbenne, Jessica, 2005. Production et biomasse bactériennes. 2ième année de BTS anabiotec. ( G. Mével)

 

 

 

- banque de données PROOF ( http://www.obs-vlfr.fr/proof/vt/op/ec/peche/pec.htm ) Le site web et la banque de données PECHE a été ré-actualisée en Octobre 2007.

 

- banque de données SISMER (IFREMER) données ADCP

(http://www.ifremer.fr/sismer/catal/campagne/campagne.htql?Crno=4040070)