École Normale Supérieure

Groupe de travail Mathématiques et Biologie

Suite à un stage au Politecnico di Milano j’ai donné une miniconférence sur l’analyse de bifurcation pour le groupe de travail Mathématique et Biologie de l’ENS en 2002. J’ai rédigé l’essentiel de ce cours que vous pouvez télécharger [PDF].

Magistère et Winter School 2002 — 2003

À la demande de Regis Ferrière j’ai utilisé mon expérience au Politecnico di Milano pour donner deux cycle de cours et TD aux élèves de biologie de l’ENS. Ces cours avaient pour objectif de décrire brievement une technique mathématique (l’analyse de bifurcations) et son application à la théorie de l’évolution (théorie des dynamiques adaptatives). La partie TD était centrée sur le logiciel XPPaut, un logiciel permettant l’analyse des équations différentielle et qui inclut les fonctions de AUTO, un puissant logiciel d’analyse de bifurcations.

Ce cours/TD a été adapté à deux groupes d’élèves:

  • Magistère Première année [1h20 cours + 1h20 TD]: cours et transparents.
  • Magistère Seconde année, pour la “Winter School in Quantitative Biology” [3h cours + 3h TD]: cours et transparents.

Master Écologie

Mes différentes expériences d’enseignement m’ont conduit à assurer, entre 2004 et 2007, deux jours de cours et TD en première année de Master à l’ENS, au sein d’un module d’Écologie à orientation théorique. Ces cours portent sur les relations interspécifiques, leur formalisation et la façon dont on peut appréhender leur évolution. Ils intègrent une partie sur l’analyse de bifurcation, technique mathématique permettant d’analyser rapidement et puissamment les systèmes d’équation différentielles utilisés dans les modèles biologiques. Les deux cours trouvent une application lors de deux séances de TD utilisant le logiciel XPPAUT.

Voici les documents associés:

  • Le cours sur les relations interspécifiques: cours et transparents [forme imprimable]
  • Le cours sur l’analyse de bifurcations: cours et transparents [forme imprimable]
  • Le TD: poly et archive [zip] contenant tous les éléments nécessaire à la réalisation du TD (les PDFs du cours et du TD, un tutorial sur XPPAUT, les fichiers d’entrée spécifiques au TD ainsi que des sauvegardes des principales analyses réalisées).

Contact

Laboratoire d'Océanographie de Villefranche

Station Zoologique, B.P. 28, Chemin du Lazaret, 06234 Villefranche-sur-Mer Cedex

irisson (at) normalesup.org
+33 (0)4 93 76 38 04

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