Procédure pour accéder aux données :

Charger l'environnement de travail : ARC_BS_B11_6900686_ALLinONE (fichier joint à cet email)


Liste des paramètres PROVBIO_Malina:

Dans R, faire 
ls()
[1] "CTDdown"   "CTDup"     "ID_FILE"   "LATITUDE"  "LONGITUDE" "OPT"      
[7] "TECH"

"CTDdown" = les mesures CTD réalisées en descente
"CTDup" = les mesures CTD réalisées en remontée
"LATITUDE" =  la latitude en décimal lorsque le profileur était en surface en fin de remontée
"LONGITUDE" = la longiude en décimal lorsque le profileur était en surface en fin de remontée
"OPT" =  les mesures optiques réalisées en remontée


Liste des paramètres dans "CTDdown" et "CTDup" :

"time" = date et heure (TU) d'enregistrement des données CTD
"pressure" = profondeur (m) * 10 
"sal" = salinité (psu) * 1000     
"sd_sal" =  déviation standard de la salinité (psu) * 1000 
"temp" = temperature (deg C) * 1000
"sd_temp" = déviation standard de ltemperature (deg C) * 1000


Liste des paramètres dans "OPT" :
Note : il y a apparremmet 3 fois plus de données optiques que de données CTD
c'est parce qu'il y a une option tri-profil sur l'optique qui n'a pas été utilisée, il y a donc des colonnes de NA dans les données OPT
 

"time" = date et heure (TU) d'enregistrement des données optiques
"pressure" = profondeur (m) * 10 
"fluo" = concentration en chl (microg.l-1)
"cdom" = concentration en CDOM (ppb)
"bb" = coefficient de retrodiffusion à 555 nm (m-1)
"tran" = coefficient d'atténuation à 660 nm (m-1)
"irr1" = éclairement descendant à 412 nm (microW.cm-2.nm-1)
"irr2" = éclairement descendant à 490 nm (microW.cm-2.nm-1)
"irr3" = éclairement descendant à 555 nm (microW.cm-2.nm-1)



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 ls.str();
CTDdown : List of 8
 $ name    : chr "CTD_Down"
 $ time    : chr [1:500, 1:31] "NA" NA NA NA ...
 $ pressure: num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sal     : num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sd_sal  : int [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ temp    : num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sd_temp : int [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ cycle   : num [1:31] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
CTDup : List of 8
 $ name    : chr "CTD_Up"
 $ time    : chr [1:500, 1:31] "NA" NA NA NA ...
 $ pressure: num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sal     : num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sd_sal  : int [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ temp    : num [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ sd_temp : int [1:500, 1:31] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ cycle   : num [1:31] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
ID_FILE :  chr [1:31] "//B_300224010345990_20090807072100_20090807072145_000037_000037.sbdB.RData" ...
LATITUDE :  num [1:31] 71.4 71.5 71.5 71.5 71.6 ...
LONGITUDE :  num [1:31] -127 -127 -127 -127 -127 ...
OPT : List of 11
 $ name    : chr "OPTIQUE"
 $ time    : chr [1:500, 1:93] "NA" NA NA NA ...
 $ pressure: num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ fluo    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ cdom    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ bb      : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ tran    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ irr1    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ irr2    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ irr3    : num [1:500, 1:93] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ cycle   : num [1:93] 1 1 1 2 2 2 3 3 3 4 ...
TECH :  int [1:500, 1:31] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...