FICROSDCOORD_DONPOMWEB_CONTROLE_MISEAJOUR
(emplacement :
D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\oxygdefexpl\fichiers_rosette_complets\ficrosdcoord_donpomweb)
8/12/2005 - C. Pocho
EXPLICATION DU REFERENCEMENT DES FICHIERS ISSUS DU
SITE WEB DE POMME (http://www.lodyc.jussieu.fr/POMME/)
ü Règles et principes :
o
Référencement des
données issues du site web de pomme.
Pour cela on les concatene à un fichier de référencement qui varie en fonction
du type de profil (vertical ou horizontal). On utilise le fichier
de référencement rosette pour les profils verticaux et celui du thermoall
(2ème fichier de référencement) pour les profils horizontaux
(continus de surface)
o
La concatenation
s’effectue en fonction du numéro de station et du numéro de bouteille excepté pour l’assimilation d’azote où la
concaténation s’est effectuée en fonction du numéro de station et de la
profondeur (on ne disposait pas du numéro de bouteille) ainsi que pour la
carbone inorganique dissous où la concaténation
en focntion du jour julien à partir du fichier thermoall comme fichier de
référencement (avec une précision à la minute, une minute = 0.0007)
o A une ligne correspond une même bouteille et une même
station. Si ce n’est pas le cas, nous sommes alors en présence d’un doublet (ou
occurrence), on précise alors le n° de station et de btl)
ü Mode de lecture de ce tableau :
o
La colonne « Nbre de lignes du fichier trame ros » indique le
nombre de lignes que comporte le fichier trame qui constitue notre trame de
référencement (fichier trame rosette ou fichier thermoall)
o
La colonne « Nbre
de lignes du fichier lu donpomweb » indique le nombre de lignes que
comporte le fichier de données issu du site web de Pomme
o
La colonne « Nbre de lignes du fichier concaténé
(trame+donpomweb) » indique le nombre de lignes que comporte le fichier
concaténé. Si ce nombre est supérieur à celui de la trame c’est que nous sommes
en présence de doublets (case en orangé). Si vous êtes en présence d’un doublet
il faut regarder les deux colonnes suivantes
o Les colonnes « Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des
n° de stations et des n° de btl » vous indiquent le numéro de station et
de bouteille du doublet. Attention en cas de présence de doublet la règle
« à une ligne correspond un seul numéro de bouteille et de station »
ne peut plus s’appliquer
ü
Actualisation effectuée en décembre 2005 : en plus des données
téléchargées de novembre 2003, on insère également celles téléchargées en oct
2004 et du carbone organique total (TOC) (téléchargées en novembre 2005)
o
Données d’octobre
2004 : Depuis le mois de novembre 2003, les mises à jour
effectuées concernent les paramètres suivants : Carbone inorganique
dissous, Carbone organique total, Microzooplancton, Paramètre fluo variable
(nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre), SeaSor
OPCT, VM-ADCP, Pièges à particules (Pièges dérivants, Pièges fixes). Les
concatenations avec le fichier de référencement ont été effectuées pour les
paramètres suivants : Carbone inorganique dissous, Paramètre fluo variable
(nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre)
o Données de novembre 2005 : traitement et concatenation du carbone organique total (TOC)
ü Classement par type de profils :
o Profils verticaux :
o
L’absorption
particulaire
o
L’assimilation d’azote
(concatenation station profondeur)
o
L’assimilation d’azote
et de carbone
o
Les bactéries
hétérotrophes
o
Les composés soufrés DMS
et DMSP
o
Flux O2/TCO2 et activité
ETS
o
Microzooplancton
o
Pigments
phytoplanctoniques
o
Production bactérienne
et rendements de croissance
o
Production primaire
(méthode 14C)
o
Sels nutritifs
(Atalante)
o
Sels nutritifs
(Thalassa)
o
Silicium
o
Compteur de particules
HIAC (rosette uniquement, continu de surface n’est pas traité)
o
Paramètre fluo variable
(en octobre 2004)
o
Paramètre photosynthétique
(en octobre 2004)
o
Le carbone organique
total (TOC) (en novembre 2005)
o Profils horizontaux :
o
Carbone inorganique
dissous (Concatenation avec le fichier
thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute) (en
novembre 2003 et en octobre2004)
Données
téléchargées en novembre 2003 :
|
TYPE DE DONNEES
|
DONNEES WEB
|
INFORMATIONS
|
LEG
|
Nbre de lignes du fichier trame ros
|
Nbre de lignes du fichier lu donpomweb
|
Nbre de lignes du fichier concaténé
(trame+donpomweb)
|
Si plus d’une ligne avec meme btl et meme
station :
Indication des n° de stations
et des n° de btl
|
Remarques et conséquences
|
|
Données issues de la rosette
|
Absorption particulaire (adet+aphyto)
|
Adet
|
P1L1
|
1893
|
745
|
1893+1=1894
|
Station 1007
|
Btl 24 présente deux fois
|
|
|
P1L2
|
1281
|
201
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
837
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
201
|
1233+11=1244
|
2276
|
Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21,
23
|
|
|
P3L1
|
1990
|
685
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
201
|
1334
|
|
|
|
|
Aphyto
|
P1L1
|
1893
|
745
|
1893+1=1894
|
1007
|
Btl 24 présente deux fois
|
|
|
P1L2
|
1281
|
201
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
837
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
201
|
1233+11=1244
|
2276
|
Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21,
23
|
|
|
P3L1
|
1990
|
685
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
201
|
1334
|
|
|
|
|
Assimilation d'azote (N15)
|
|
P1L2
|
1281
|
38
|
1281
|
|
|
Concatenation en fonction N°station et prof
|
|
P2L2
|
1233
|
31
|
1233
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
32
|
1334
|
|
|
|
Assimilation d'azote (N15) et de carbone (C13)
|
|
P1L1
|
1893
|
162
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
132
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
108
|
1990
|
|
|
|
|
Bactéries hétérotrophes
|
|
P2L1
|
1702
|
1001
|
1702
|
|
|
|
|
Carbone inorganique dissous
|
|
P1L1
|
1893
|
1096
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
667
|
1702
|
|
|
Pb de décalage de lignes qui a été corrigé
|
|
P3L1
|
1990
|
1159
|
1990
|
|
|
Pb de décalage de lignes qui a été corrigé
|
|
Carbone Organique total (TOC)
|
Données éparses
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Composés soufrés DMS et DMSP
|
|
P1L1
|
1893
|
234
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
399
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
373
|
1990
|
|
|
|
|
CTD-rosette et surface (Atalante)
|
CTD (toutes variables “continues”, tous les mètres
et 5 m)
Rosette (fichier prof btl)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CTD-Rosette (Thalassa)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CTD-O2 et CTD-Rosette (Atalante) (Août 2003)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CTD (D'Entrecasteaux), XCTD et XBT
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Flux O2/TCO2 et Activité ETS
|
Activité ETS
|
P1L2
|
1281
|
162
|
1281+1=1282
|
1087
|
Deux fois btl 4
|
Rajout d’une col au sein du fichier pour
distinguer les doublets
|
|
P2L2
|
1233
|
162
|
1233+1=1234
|
2408
|
Deux fois btl 1
|
Rajout d’une col au sein du fichier pour
distinguer les doublets
|
|
P3L2
|
1334
|
164
|
1334
|
|
|
|
|
Flux O2/TCO2
|
P0
|
|
|
|
|
|
NON TRAITE
|
|
P1L1
|
1893
|
23
|
1893
|
|
|
Il manque sur le fichier trame la btl 23 et 24 pour
la station 1025
|
|
P1L2
|
1281
|
34
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
38
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
32
|
1233
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
20
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
32
|
1334
|
|
|
|
|
Microzooplancton
|
De 0 à 100m
|
P1L1
|
1893
|
29
|
1893
|
|
|
|
|
P1L2
|
1281
|
32
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
53
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
31
|
1233
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
81
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
36
|
1334
|
|
|
|
|
Pigments phytoplanctoniques
|
|
P1L1
|
1893
|
731
|
1893
|
|
|
|
|
P1L2
|
1281
|
164
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
868
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
106
|
1233
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
783
|
1990+1=1991
|
3019
|
Deux fois btl 24
|
Rajout d’1 col pour les btl bis
|
|
P3L2
|
1334
|
121
|
1334
|
|
|
|
|
Production bactérienne et rendements de croissance
|
Prod bact
|
P1L1
|
1893
|
268
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
531
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
616
|
1990
|
|
|
|
|
Rend croiss
|
P1L2
|
1281
|
25
|
1281
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
24
|
1233
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
24
|
1334
|
|
|
|
|
Production primaire (méthode 14C)
|
|
P1L2
|
1281
|
34
|
1281
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
31
|
1233
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
32
|
1334
|
|
|
|
|
Sels nutritifs (Atalante)
|
Données discontinues
|
P1L1
|
1893
|
1600
|
1893
|
|
|
|
|
P1L2
|
1281
|
315
|
1281
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
1701
|
1702
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
211
|
1233
|
|
|
|
|
Sels nutritifs (D'Entrecasteaux)
|
N° CTD
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Sels nutritifs (Thalassa)
|
|
P3L1
|
1990
|
1712
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
374
|
1334
|
|
|
|
|
Silicium
|
|
P1L2
|
1281
|
117
|
1281
|
|
|
|
|
P2L2
|
1233
|
100
|
1233
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
221
|
1334
|
|
|
|
|
Compteur de particules HIAC
(rosette uniquement)
|
Fichier niveau1 :
Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le
continu de surface
N1 ROSETTE :
|
P1L1
|
1893
|
1466
|
1893+6=1899
|
1005
1064
1069
|
1005 : deux fois btl 1
1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10
1069 : une btl en surface
|
|
|
P1L2
|
1281
|
487
|
1281
|
1092
|
Deux fois btl 12 et 13
|
|
|
P2L1
|
1702
|
1638
|
1702
|
2035
2051
|
2035 : deux fois btl 10
2051 : deux fois btl 7
|
|
|
P2L2
|
1233
|
526
|
1233
|
|
|
Pb décalage légende qui a été corrigé
|
|
P3L1
|
1990
|
1702
|
1990
|
|
|
Pb décalage légende qui a été corrigé
|
|
P3L2
|
1334
|
502
|
1334
|
|
|
|
|
Fichiers niveau 2 :
Concentrations, tailles moy et biovolume des
particules
N2 ROSETTE :
|
P1L1
|
1893
|
1467
|
1893
|
1005
1064
1069
|
1005 : deux fois btl 1
1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10
1069 : une btl en surface
|
|
|
P1L2
|
1281
|
487
|
1281
|
1092
|
Deux fois btl 12 et 13
|
|
|
P2L1
|
1702
|
1638
|
1702
|
2035
2051
|
2035 : deux fois btl 10
2051 : deux fois btl 7
|
|
|
P2L2
|
1233
|
526
|
1233
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
1702
|
1990
|
|
|
|
|
P3L2
|
1334
|
502
|
1334
|
|
|
|
Données téléchargées en
octobre 2004 : (mise à jour)
|
TYPE DE DONNEES
|
DONNEES WEB
|
INFORMATIONS
|
LEG
|
Nbre de lignes du fichier trame ros ou du
fichier trame thermoall
|
Nbre de lignes du fichier lu donpomweb
|
Nbre de lignes du fichier concaténé
(trame+donpomweb)
|
Si plus d’une ligne avec meme btl et meme
station :
Indication des n° de stations
et des n° de btl
|
Remarques et conséquences
|
|
|
Carbone inorganique dissous
|
|
P1L1
|
30 827
|
2651
|
30 827
|
|
|
Concatenation avec le
fichier thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute
|
|
P2L1
|
29 977
|
1667
|
29 977
|
|
|
|
|
P3L1
|
30 929
|
13 459
|
30 929
|
|
|
|
|
Paramètre fluo variable
|
|
P1L1
|
1893
|
768
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
888
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
895
|
1990
|
|
|
|
|
Paramètre photosynthétique
|
|
P1L1
|
1893
|
118
|
1893+4=1897[bd proof1]
|
1070
1075
|
Deux fois btl 23 et 24
Deux fois btl 23 et 24
|
Doublets
Col n° station = col 3 du
fichier donpomweb
|
|
P2L1
|
1702
|
140
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
98
|
1990
|
|
|
|
Données téléchargées en
novembre 2005 : (mise à jour)
|
TYPE DE DONNEES
|
DONNEES WEB
|
INFORMATIONS
|
LEG
|
Nbre de lignes du fichier trame ros
|
Nbre de lignes du fichier lu donpomweb
|
Nbre de lignes du fichier concaténé
(trame+donpomweb)
|
Si plus d’une ligne avec meme btl et meme
station :
Indication des n° de stations
et des n° de btl
|
Remarques et conséquences
|
|
Données issues de la rosette
|
Carbone Organique total (TOC)
|
|
P1L1
|
1893
|
1224
|
1893
|
|
|
|
|
P2L1
|
1702
|
1248
|
1702
|
|
|
|
|
P3L1
|
1990
|
1080
|
1993
|
|
|
|
Données téléchargées en
novembre 2003 :
|
TYPE DE DONNEES
|
DONNEES WEB
|
INFORMATIONS
|
LEG
|
Nbre de lignes du fichier trame ros
|
Nbre de lignes du fichier lu donpomweb
|
Nbre de lignes du fichier concaténé
(trame+donpomweb)
|
Si plus d’une ligne avec meme btl et meme
station :
Indication des n° de stations
et des n° de btl
|
Remarques
|
|
Autres types de données
|
Chimie DTX
|
Fichier annexe2 :
Prélévements de surface
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Compteur de particules HIAC
(continu de surface uniquement)
|
Fichier niveau1 :
Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le
continu de surface
Fichiers niveau 2 :
Concentrations, tailles moy et biovolume des
particules
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CTD-rosette et surface (Atalante)
|
Thermosalino
Meteo
Navigation
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Paramètres météo-océaniques et flux radiatifs
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Radio-sondages
|
(sondages)
|
|
|
|
|
|
|
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SeaSoar-OPCT
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(radiales)
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VM-ADCP
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Chimie DTX
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Fichier annexe1 :
profils verticaux
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Compteur optique de plancton (OPC)
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Radiales
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Fer
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Pièges à particules
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Pièges fixes
Pièges dérivants (Flux+Carb total et azote)
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Profils bio-optique
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Zooplancton
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Bioness
WPII
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ü Un tableau de synthèse des doublets est présenté
ci-dessous :
o
Rq : P0 n’a pas été
traité et P3L2 ne contient aucun doublet
o
Rq : Les données
concernées par la présence de doublets sont :
·
Abs particulaire
(adet+aphyto)
·
Flux O2/TCO2 activ ETS
·
Pigments phyto
·
HIAC pour rosette N1 et
N2 uniquement (pas les continus de surface)
·
Paramètre
photosynthétique
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Leg
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N° STATIONS où doublets
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N° BTL où doublets
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P0
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Non traité
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Non traité
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P1L1
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1005
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Deux fois btl 1
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1007
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Deux fois btl 24
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1064
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Deux fois btl 5, 6, 9, 10
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1069
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Une btl en surface
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1070
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Deux fois btl 23 et 24
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1075
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Deux fois btl 23 et 24
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P1L2
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1087
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Deux fois btl 4
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1092
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Deux fois btl 12, 13
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P2L1
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2035
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Deux fois btl 10
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2051
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Deux fois btl 7
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P2L2
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2276
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Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21,
23
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2408
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Deux fois btl 1
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P3L1
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3019
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Deux fois btl 24
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P3L2
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/
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/
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