FICROSDCOORD_DONPOMWEB_CONTROLE_MISEAJOUR

(emplacement : D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\oxygdefexpl\fichiers_rosette_complets\ficrosdcoord_donpomweb)

8/12/2005 - C. Pocho

 

EXPLICATION DU REFERENCEMENT DES FICHIERS ISSUS DU SITE WEB DE POMME (http://www.lodyc.jussieu.fr/POMME/)

ü     Règles et principes :

o       Référencement des données issues du site web de pomme. Pour cela on les concatene à un fichier de référencement qui varie en fonction du type de profil (vertical ou horizontal). On utilise le fichier de référencement rosette pour les profils verticaux et celui du thermoall (2ème fichier de référencement) pour les profils horizontaux (continus de surface)

o       La concatenation s’effectue en fonction du numéro de station et du numéro de bouteille excepté pour l’assimilation d’azote où la concaténation s’est effectuée en fonction du numéro de station et de la profondeur (on ne disposait pas du numéro de bouteille) ainsi que pour la carbone inorganique dissous où la concaténation en focntion du jour julien à partir du fichier thermoall comme fichier de référencement (avec une précision à la minute, une minute = 0.0007)

o       A une ligne correspond une même bouteille et une même station. Si ce n’est pas le cas, nous sommes alors en présence d’un doublet (ou occurrence), on précise alors le n° de station et de btl)

ü     Mode de lecture de ce tableau :

o       La colonne « Nbre de lignes du fichier trame ros » indique le nombre de lignes que comporte le fichier trame qui constitue notre trame de référencement (fichier trame rosette ou fichier thermoall)

o       La colonne « Nbre de lignes du fichier lu donpomweb » indique le nombre de lignes que comporte le fichier de données issu du site web de Pomme

o       La colonne « Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb) » indique le nombre de lignes que comporte le fichier concaténé. Si ce nombre est supérieur à celui de la trame c’est que nous sommes en présence de doublets (case en orangé). Si vous êtes en présence d’un doublet il faut regarder les deux colonnes suivantes

o       Les colonnes « Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl » vous indiquent le numéro de station et de bouteille du doublet. Attention en cas de présence de doublet la règle « à une ligne correspond un seul numéro de bouteille et de station » ne peut plus s’appliquer

ü     Actualisation effectuée en décembre 2005 : en plus des données téléchargées de novembre 2003, on insère également celles téléchargées en oct 2004 et du carbone organique total (TOC) (téléchargées en novembre 2005)

o       Données d’octobre 2004 : Depuis le mois de novembre 2003, les mises à jour effectuées concernent les paramètres suivants : Carbone inorganique dissous, Carbone organique total, Microzooplancton, Paramètre fluo variable (nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre), SeaSor OPCT, VM-ADCP, Pièges à particules (Pièges dérivants, Pièges fixes). Les concatenations avec le fichier de référencement ont été effectuées pour les paramètres suivants : Carbone inorganique dissous, Paramètre fluo variable (nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre)

o       Données de novembre 2005 : traitement et concatenation du carbone organique total (TOC)

ü     Classement par type de profils :

o       Profils verticaux :


o        L’absorption particulaire

o        L’assimilation d’azote (concatenation station profondeur)

o        L’assimilation d’azote et de carbone

o        Les bactéries hétérotrophes

o        Les composés soufrés DMS et DMSP

o        Flux O2/TCO2 et activité ETS

o        Microzooplancton

o        Pigments phytoplanctoniques

o        Production bactérienne et rendements de croissance

o        Production primaire (méthode 14C)

o        Sels nutritifs (Atalante)

o        Sels nutritifs (Thalassa)

o        Silicium

o        Compteur de particules HIAC (rosette uniquement, continu de surface n’est pas traité)

o        Paramètre fluo variable (en octobre 2004)

o        Paramètre photosynthétique (en octobre 2004)

o        Le carbone organique total (TOC) (en novembre 2005)


o       Profils horizontaux :

o     Carbone inorganique dissous (Concatenation avec le fichier thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute) (en novembre 2003 et en octobre2004)

 

DONNEES REFERENCEES

 

Données téléchargées en novembre 2003 :

 

TYPE DE DONNEES

DONNEES WEB

INFORMATIONS

LEG

Nbre de lignes du fichier trame ros

Nbre de lignes du fichier lu donpomweb

Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)

Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station :

 

Indication des n° de stations

et des n° de btl

Remarques et conséquences

Données issues de la rosette

Absorption particulaire (adet+aphyto)

Adet

 

P1L1

1893

745

1893+1=1894

Station 1007

Btl 24 présente deux fois

 

P1L2

1281

201

1281

 

 

 

P2L1

1702

837

1702

 

 

 

P2L2

1233

201

1233+11=1244

2276

Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23

 

P3L1

1990

685

1990

 

 

 

P3L2

1334

201

1334

 

 

 

Aphyto

P1L1

1893

745

1893+1=1894

1007

Btl 24 présente deux fois

 

P1L2

1281

201

1281

 

 

 

P2L1

1702

837

1702

 

 

 

P2L2

1233

201

1233+11=1244

2276

Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23

 

P3L1

1990

685

1990

 

 

 

P3L2

1334

201

1334

 

 

 

Assimilation d'azote (N15)

 

P1L2

1281

38

1281

 

 

Concatenation en fonction N°station et prof

P2L2

1233

31

1233

 

 

P3L2

1334

32

1334

 

 

Assimilation d'azote (N15) et de carbone (C13)

 

P1L1

1893

162

1893

 

 

 

P2L1

1702

132

1702

 

 

 

P3L1

1990

108

1990

 

 

 

Bactéries hétérotrophes

 

P2L1

1702

1001

1702

 

 

 

Carbone inorganique dissous

 

P1L1

1893

1096

1893

 

 

 

P2L1

1702

667

1702

 

 

Pb de décalage de lignes qui a été corrigé

P3L1

1990

1159

1990

 

 

Pb de décalage de lignes qui a été corrigé

Carbone Organique total (TOC)

Données éparses

 

 

 

 

 

 

 

Composés soufrés DMS et DMSP

 

P1L1

1893

234

1893

 

 

 

P2L1

1702

399

1702

 

 

 

P3L1

1990

373

1990

 

 

 

CTD-rosette et surface (Atalante)

 

CTD (toutes variables “continues”, tous les mètres et 5 m)

 

Rosette (fichier prof btl)

 

 

 

 

 

 

 

CTD-Rosette (Thalassa)

 

 

 

 

 

 

 

 

CTD-O2 et CTD-Rosette (Atalante) (Août 2003)

 

 

 

 

 

 

 

 

CTD (D'Entrecasteaux), XCTD et XBT

 

 

 

 

 

 

 

 

Flux O2/TCO2 et Activité ETS

Activité ETS

P1L2

1281

162

1281+1=1282

1087

Deux fois btl 4

Rajout d’une col au sein du fichier pour distinguer les doublets

P2L2

1233

162

1233+1=1234

2408

Deux fois btl 1

Rajout d’une col au sein du fichier pour distinguer les doublets

P3L2

1334

164

1334

 

 

 

Flux O2/TCO2

P0

 

 

 

 

 

NON TRAITE

P1L1

1893

23

1893

 

 

Il manque sur le fichier trame la btl 23 et 24 pour la station 1025

P1L2

1281

34

1281

 

 

 

P2L1

1702

38

1702

 

 

 

P2L2

1233

32

1233

 

 

 

P3L1

1990

20

1990

 

 

 

P3L2

1334

32

1334

 

 

 

Microzooplancton

De 0 à 100m

P1L1

1893

29

1893

 

 

 

P1L2

1281

32

1281

 

 

 

P2L1

1702

53

1702

 

 

 

P2L2

1233

31

1233

 

 

 

P3L1

1990

81

1990

 

 

 

P3L2

1334

36

1334

 

 

 

Pigments phytoplanctoniques

 

P1L1

1893

731

1893

 

 

 

P1L2

1281

164

1281

 

 

 

P2L1

1702

868

1702

 

 

 

P2L2

1233

106

1233

 

 

 

P3L1

1990

783

1990+1=1991

3019

Deux fois btl 24

Rajout d’1 col pour les btl bis

P3L2

1334

121

1334

 

 

 

Production bactérienne et rendements de croissance

Prod bact

P1L1

1893

268

1893

 

 

 

P2L1

1702

531

1702

 

 

 

P3L1

1990

616

1990

 

 

 

Rend croiss

P1L2

1281

25

1281

 

 

 

P2L2

1233

24

1233

 

 

 

P3L2

1334

24

1334

 

 

 

Production primaire (méthode 14C)

 

P1L2

1281

34

1281

 

 

 

P2L2

1233

31

1233

 

 

 

P3L2

1334

32

1334

 

 

 

Sels nutritifs (Atalante)

Données discontinues

P1L1

1893

1600

1893

 

 

 

P1L2

1281

315

1281

 

 

 

P2L1

1702

1701

1702

 

 

 

P2L2

1233

211

1233

 

 

 

Sels nutritifs (D'Entrecasteaux)

N° CTD

 

 

 

 

 

 

 

Sels nutritifs (Thalassa)

 

P3L1

1990

1712

1990

 

 

 

P3L2

1334

374

1334

 

 

 

Silicium

 

P1L2

1281

117

1281

 

 

 

P2L2

1233

100

1233

 

 

 

P3L2

1334

221

1334

 

 

 

Compteur de particules HIAC

(rosette uniquement)

Fichier niveau1 :

Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le continu de surface

 

N1 ROSETTE :

P1L1

1893

1466

1893+6=1899

1005

1064

1069

1005 : deux fois btl 1

1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10

1069 : une btl en surface

 

P1L2

1281

487

1281

1092

Deux fois btl 12 et 13

 

P2L1

1702

1638

1702

2035

2051

2035 : deux fois btl 10

2051 : deux fois btl 7

 

P2L2

1233

526

1233

 

 

Pb décalage légende qui a été corrigé

P3L1

1990

1702

1990

 

 

Pb décalage légende qui a été corrigé

P3L2

1334

502

1334

 

 

 

Fichiers niveau 2 :

Concentrations, tailles moy et biovolume des particules

 

N2 ROSETTE :

P1L1

1893

1467

1893

1005

1064

1069

1005 : deux fois btl 1

1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10

1069 : une btl en surface

 

P1L2

1281

487

1281

1092

Deux fois btl 12 et 13

 

P2L1

1702

1638

1702

2035

2051

2035 : deux fois btl 10

2051 : deux fois btl 7

 

P2L2

1233

526

1233

 

 

 

P3L1

1990

1702

1990

 

 

 

P3L2

1334

502

1334

 

 

 

 

Données téléchargées en octobre 2004 : (mise à jour)

 

TYPE DE DONNEES

DONNEES WEB

INFORMATIONS

LEG

Nbre de lignes du fichier trame ros ou du fichier  trame thermoall

Nbre de lignes du fichier lu donpomweb

Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)

Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station :

 

Indication des n° de stations

et des n° de btl

Remarques et conséquences

 

Carbone inorganique dissous

 

P1L1

30 827

2651

30 827

 

 

Concatenation avec le fichier thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute

P2L1

29 977

1667

29 977

 

 

 

P3L1

30 929

13 459

30 929

 

 

 

Paramètre fluo variable

 

P1L1

1893

768

1893

 

 

 

P2L1

1702

888

1702

 

 

 

P3L1

1990

895

1990

 

 

 

Paramètre photosynthétique

 

P1L1

1893

118

1893+4=1897[bd proof1] 

1070

1075

Deux fois btl 23 et 24

Deux fois btl 23 et 24

Doublets

Col n° station = col 3 du fichier donpomweb

P2L1

1702

140

1702

 

 

 

P3L1

1990

98

1990

 

 

 

 

Données téléchargées en novembre 2005 : (mise à jour)

 

TYPE DE DONNEES

DONNEES WEB

INFORMATIONS

LEG

Nbre de lignes du fichier trame ros

Nbre de lignes du fichier lu donpomweb

Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)

Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station :

 

Indication des n° de stations

et des n° de btl

Remarques et conséquences

Données issues de la rosette

Carbone Organique total (TOC)

 

P1L1

1893

1224

1893

 

 

 

P2L1

1702

1248

1702

 

 

 

P3L1

1990

1080

1993

 

 

 

 

 

 

DONNEES NON REFERENCEES

 

Données téléchargées en novembre 2003 :

 

TYPE DE DONNEES

DONNEES WEB

INFORMATIONS

LEG

Nbre de lignes du fichier trame ros

Nbre de lignes du fichier lu donpomweb

Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)

Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station :

 

Indication des n° de stations

et des n° de btl

Remarques

Autres types de données

Chimie DTX

 

Fichier annexe2 :

Prélévements de surface

 

 

 

 

 

 

 

Compteur de particules HIAC

(continu de surface uniquement)

Fichier niveau1 :

Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le continu de surface

Fichiers niveau 2 :

Concentrations, tailles moy et biovolume des particules

 

 

 

 

 

 

 

CTD-rosette et surface (Atalante)

 

Thermosalino

Meteo

Navigation

 

 

 

 

 

 

 

Paramètres météo-océaniques et flux radiatifs

 

 

 

 

 

 

 

 

Radio-sondages

(sondages)

 

 

 

 

 

 

 

SeaSoar-OPCT

(radiales)

 

 

 

 

 

 

 

VM-ADCP

 

 

 

 

 

 

 

 

Chimie DTX

 

Fichier annexe1 :

profils verticaux

 

 

 

 

 

 

 

Compteur optique de plancton (OPC)

Radiales

 

 

 

 

 

 

 

Fer

 

 

 

 

 

 

 

 

Pièges à particules

Pièges fixes

Pièges dérivants (Flux+Carb total et azote)

 

 

 

 

 

 

 

Profils bio-optique

 

 

 

 

 

 

 

 

Zooplancton

Bioness

WPII

 

 

 

 

 

 

 

 

ü     Un tableau de synthèse des doublets est présenté ci-dessous :

o       Rq : P0 n’a pas été traité et P3L2 ne contient aucun doublet

o       Rq : Les données concernées par la présence de doublets sont :

·       Abs particulaire (adet+aphyto)

·       Flux O2/TCO2 activ ETS

·       Pigments phyto

·       HIAC pour rosette N1 et N2 uniquement (pas les continus de surface)

·       Paramètre photosynthétique

 

Leg

N° STATIONS où doublets

N° BTL où doublets

P0

Non traité

Non traité

P1L1

1005

Deux fois btl 1

1007

Deux fois btl 24

1064

Deux fois btl 5, 6, 9, 10

1069

Une btl en surface

1070

Deux fois btl 23 et 24

1075

Deux fois btl 23 et 24

P1L2

1087

Deux fois btl 4

1092

Deux fois btl 12, 13

P2L1

2035

Deux fois btl 10

2051

Deux fois btl 7

P2L2

2276

Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23

2408

Deux fois btl 1

P3L1

3019

Deux fois btl 24

P3L2

/

/

 


 [bd proof1]Ce fichier n est pas comparable aux autres car 4 lignes supplementaires ont du etre ajoutees ayant pour cause la redondance de no btl

ce sera la caracteristique des cellules oranges