FICROSDCOORD_DONPOMWEB_CONTROLE_MISEAJOUR

(emplacement : D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\oxygdefexpl\fichiers_rosette_complets\ficrosdcoord_donpomweb)

8/12/2005 - C. Pocho

EXPLICATION DU REFERENCEMENT DES FICHIERS ISSUS DU SITE WEB DE POMME (http://www.lodyc.jussieu.fr/POMME/)

ü Règles et principes :

o Référencement des données issues du site web de pomme. Pour cela on les concatene à un fichier de référencement qui varie en fonction du type de profil (vertical ou horizontal). On utilise le fichier de référencement rosette pour les profils verticaux et celui du thermoall (2^ème fichier de référencement) pour les profils horizontaux (continus de surface)

o La concatenation s’effectue en fonction du numéro de station et du numéro de bouteille excepté pour l’assimilation d’azote où la concaténation s’est effectuée en fonction du numéro de station et de la profondeur (on ne disposait pas du numéro de bouteille) ainsi que pour la carbone inorganique dissous où la concaténation en focntion du jour julien à partir du fichier thermoall comme fichier de référencement (avec une précision à la minute, une minute = 0.0007)

o A une ligne correspond une même bouteille et une même station. Si ce n’est pas le cas, nous sommes alors en présence d’un doublet (ou occurrence), on précise alors le n° de station et de btl)

ü Mode de lecture de ce tableau :

o La colonne « Nbre de lignes du fichier trame ros » indique le nombre de lignes que comporte le fichier trame qui constitue notre trame de référencement (fichier trame rosette ou fichier thermoall)

o La colonne « Nbre de lignes du fichier lu donpomweb » indique le nombre de lignes que comporte le fichier de données issu du site web de Pomme

o La colonne « Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb) » indique le nombre de lignes que comporte le fichier concaténé. Si ce nombre est supérieur à celui de la trame c’est que nous sommes en présence de doublets (case en orangé). Si vous êtes en présence d’un doublet il faut regarder les deux colonnes suivantes

o Les colonnes « Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl » vous indiquent le numéro de station et de bouteille du doublet. Attention en cas de présence de doublet la règle « à une ligne correspond un seul numéro de bouteille et de station » ne peut plus s’appliquer

ü Actualisation effectuée en décembre 2005 : en plus des données téléchargées de novembre 2003, on insère également celles téléchargées en oct 2004 et du carbone organique total (TOC) (téléchargées en novembre 2005)

o Données d’octobre 2004 : Depuis le mois de novembre 2003, les mises à jour effectuées concernent les paramètres suivants : Carbone inorganique dissous, Carbone organique total, Microzooplancton, Paramètre fluo variable (nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre), SeaSor OPCT, VM-ADCP, Pièges à particules (Pièges dérivants, Pièges fixes). Les concatenations avec le fichier de référencement ont été effectuées pour les paramètres suivants : Carbone inorganique dissous, Paramètre fluo variable (nouveau paramètre), Paramètres photosynthétiques (nouveau paramètre)

o Données de novembre 2005 : traitement et concatenation du carbone organique total (TOC)

ü Classement par type de profils :

o Profils verticaux :

o L’absorption particulaire

o L’assimilation d’azote (concatenation station profondeur)

o L’assimilation d’azote et de carbone

o Les bactéries hétérotrophes

o Les composés soufrés DMS et DMSP

o Flux O2/TCO2 et activité ETS

o Microzooplancton

o Pigments phytoplanctoniques

o Production bactérienne et rendements de croissance

o Production primaire (méthode 14C)

o Sels nutritifs (Atalante)

o Sels nutritifs (Thalassa)

o Silicium

o Compteur de particules HIAC (rosette uniquement, continu de surface n’est pas traité)

o Paramètre fluo variable (en octobre 2004)

o Paramètre photosynthétique (en octobre 2004)

o Le carbone organique total (TOC) (en novembre 2005)

o Profils horizontaux :

o Carbone inorganique dissous (Concatenation avec le fichier thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute) (en novembre 2003 et en octobre2004)

DONNEES REFERENCEES

Données téléchargées en novembre 2003 :

TYPE DE DONNEES	DONNEES WEB	INFORMATIONS	LEG	Nbre de lignes du fichier trame ros	Nbre de lignes du fichier lu donpomweb	Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)	Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl		Remarques et conséquences
Données issues de la rosette	Absorption particulaire (adet+aphyto)	Adet	P1L1	1893	745	1893+1=1894	Station 1007	Btl 24 présente deux fois
			P1L2	1281	201	1281
			P2L1	1702	837	1702
			P2L2	1233	201	1233+11=1244	2276	Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23
			P3L1	1990	685	1990
			P3L2	1334	201	1334
		Aphyto	P1L1	1893	745	1893+1=1894	1007	Btl 24 présente deux fois
			P1L2	1281	201	1281
			P2L1	1702	837	1702
			P2L2	1233	201	1233+11=1244	2276	Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23
			P3L1	1990	685	1990
			P3L2	1334	201	1334
	Assimilation d'azote (N15)		P1L2	1281	38	1281			Concatenation en fonction N°station et prof
			P2L2	1233	31	1233
			P3L2	1334	32	1334
	Assimilation d'azote (N15) et de carbone (C13)		P1L1	1893	162	1893
			P2L1	1702	132	1702
			P3L1	1990	108	1990
	Bactéries hétérotrophes		P2L1	1702	1001	1702
	Carbone inorganique dissous		P1L1	1893	1096	1893
			P2L1	1702	667	1702			Pb de décalage de lignes qui a été corrigé
			P3L1	1990	1159	1990			Pb de décalage de lignes qui a été corrigé
	Carbone Organique total (TOC)	Données éparses
	Composés soufrés DMS et DMSP		P1L1	1893	234	1893
			P2L1	1702	399	1702
			P3L1	1990	373	1990
	CTD-rosette et surface (Atalante)	CTD (toutes variables “continues”, tous les mètres et 5 m) Rosette (fichier prof btl)
	CTD-Rosette (Thalassa)
	CTD-O2 et CTD-Rosette (Atalante) (Août 2003)
	CTD (D'Entrecasteaux), XCTD et XBT
	Flux O2/TCO2 et Activité ETS	Activité ETS	P1L2	1281	162	1281+1=1282	1087	Deux fois btl 4	Rajout d’une col au sein du fichier pour distinguer les doublets
			P2L2	1233	162	1233+1=1234	2408	Deux fois btl 1	Rajout d’une col au sein du fichier pour distinguer les doublets
			P3L2	1334	164	1334
		Flux O2/TCO2	P0						NON TRAITE
			P1L1	1893	23	1893			Il manque sur le fichier trame la btl 23 et 24 pour la station 1025
			P1L2	1281	34	1281
			P2L1	1702	38	1702
			P2L2	1233	32	1233
			P3L1	1990	20	1990
			P3L2	1334	32	1334
	Microzooplancton	De 0 à 100m	P1L1	1893	29	1893
			P1L2	1281	32	1281
			P2L1	1702	53	1702
			P2L2	1233	31	1233
			P3L1	1990	81	1990
			P3L2	1334	36	1334
	Pigments phytoplanctoniques		P1L1	1893	731	1893
			P1L2	1281	164	1281
			P2L1	1702	868	1702
			P2L2	1233	106	1233
			P3L1	1990	783	1990+1=1991	3019	Deux fois btl 24	Rajout d’1 col pour les btl bis
			P3L2	1334	121	1334
	Production bactérienne et rendements de croissance	Prod bact	P1L1	1893	268	1893
			P2L1	1702	531	1702
			P3L1	1990	616	1990
		Rend croiss	P1L2	1281	25	1281
			P2L2	1233	24	1233
			P3L2	1334	24	1334
	Production primaire (méthode 14C)		P1L2	1281	34	1281
			P2L2	1233	31	1233
			P3L2	1334	32	1334
	Sels nutritifs (Atalante)	Données discontinues	P1L1	1893	1600	1893
			P1L2	1281	315	1281
			P2L1	1702	1701	1702
P2L2			1233	211	1233
Sels nutritifs (D'Entrecasteaux)	N° CTD
Sels nutritifs (Thalassa)		P3L1	1990	1712	1990
		P3L2	1334	374	1334
Silicium		P1L2	1281	117	1281
		P2L2	1233	100	1233
		P3L2	1334	221	1334
Compteur de particules HIAC (rosette uniquement)	Fichier niveau1 : Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le continu de surface N1 ROSETTE :	P1L1	1893	1466	1893+6=1899	1005 1064 1069	1005 : deux fois btl 1 1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10 1069 : une btl en surface
		P1L2	1281	487	1281	1092	Deux fois btl 12 et 13
		P2L1	1702	1638	1702	2035 2051	2035 : deux fois btl 10 2051 : deux fois btl 7
		P2L2	1233	526	1233			Pb décalage légende qui a été corrigé
		P3L1	1990	1702	1990			Pb décalage légende qui a été corrigé
		P3L2	1334	502	1334
	Fichiers niveau 2 : Concentrations, tailles moy et biovolume des particules N2 ROSETTE :	P1L1	1893	1467	1893	1005 1064 1069	1005 : deux fois btl 1 1064 : deux fois btl 5, 6, 9, 10 1069 : une btl en surface
		P1L2	1281	487	1281	1092	Deux fois btl 12 et 13
		P2L1	1702	1638	1702	2035 2051	2035 : deux fois btl 10 2051 : deux fois btl 7
		P2L2	1233	526	1233
		P3L1	1990	1702	1990
		P3L2	1334	502	1334

Données téléchargées en octobre 2004 : (mise à jour)

TYPE DE DONNEES	DONNEES WEB	INFORMATIONS	LEG	Nbre de lignes du fichier trame ros ou du fichier trame thermoall	Nbre de lignes du fichier lu donpomweb	Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)	Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl		Remarques et conséquences
	Carbone inorganique dissous		P1L1	30 827	2651	30 827			Concatenation avec le fichier thermoall en focntion du jour julien avec une précision à la minute
			P2L1	29 977	1667	29 977
			P3L1	30 929	13 459	30 929
	Paramètre fluo variable		P1L1	1893	768	1893
			P2L1	1702	888	1702
			P3L1	1990	895	1990
	Paramètre photosynthétique		P1L1	1893	118	1893+4=1897[bd proof1]	1070 1075	Deux fois btl 23 et 24 Deux fois btl 23 et 24	Doublets Col n° station = col 3 du fichier donpomweb
			P2L1	1702	140	1702
			P3L1	1990	98	1990

Données téléchargées en novembre 2005 : (mise à jour)

TYPE DE DONNEES	DONNEES WEB	INFORMATIONS	LEG	Nbre de lignes du fichier trame ros	Nbre de lignes du fichier lu donpomweb	Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)	Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl	Remarques et conséquences
Données issues de la rosette	Carbone Organique total (TOC)		P1L1	1893	1224	1893
			P2L1	1702	1248	1702
			P3L1	1990	1080	1993

DONNEES NON REFERENCEES

Données téléchargées en novembre 2003 :

TYPE DE DONNEES	DONNEES WEB	INFORMATIONS	LEG	Nbre de lignes du fichier trame ros	Nbre de lignes du fichier lu donpomweb	Nbre de lignes du fichier concaténé (trame+donpomweb)	Si plus d’une ligne avec meme btl et meme station : Indication des n° de stations et des n° de btl	Remarques
Autres types de données	Chimie DTX	Fichier annexe2 : Prélévements de surface
	Compteur de particules HIAC (continu de surface uniquement)	Fichier niveau1 : Echantillons prélevés sur la rosette ou sur le continu de surface Fichiers niveau 2 : Concentrations, tailles moy et biovolume des particules
	CTD-rosette et surface (Atalante)	Thermosalino Meteo Navigation
	Paramètres météo-océaniques et flux radiatifs
	Radio-sondages	(sondages)
	SeaSoar-OPCT	(radiales)
	VM-ADCP
	Chimie DTX	Fichier annexe1 : profils verticaux
	Compteur optique de plancton (OPC)	Radiales
	Fer
	Pièges à particules	Pièges fixes Pièges dérivants (Flux+Carb total et azote)
	Profils bio-optique
	Zooplancton	Bioness WPII

ü Un tableau de synthèse des doublets est présenté ci-dessous :

o Rq : P0 n’a pas été traité et P3L2 ne contient aucun doublet

o Rq : Les données concernées par la présence de doublets sont :

· Abs particulaire (adet+aphyto)

· Flux O2/TCO2 activ ETS

· Pigments phyto

· HIAC pour rosette N1 et N2 uniquement (pas les continus de surface)

· Paramètre photosynthétique

Leg	N° STATIONS où doublets	N° BTL où doublets
P0	Non traité	Non traité
P1L1	1005	Deux fois btl 1
	1007	Deux fois btl 24
	1064	Deux fois btl 5, 6, 9, 10
	1069	Une btl en surface
	1070	Deux fois btl 23 et 24
	1075	Deux fois btl 23 et 24
P1L2	1087	Deux fois btl 4
	1092	Deux fois btl 12, 13
P2L1	2035	Deux fois btl 10
	2051	Deux fois btl 7
P2L2	2276	Deux fois btl 7, 8, 9, 10, 11, 12, 17, 18, 19, 21, 23
	2408	Deux fois btl 1
P3L1	3019	Deux fois btl 24
P3L2	/	/

---

[bd proof1]Ce fichier n est pas comparable aux autres car 4 lignes supplementaires ont du etre ajoutees ayant pour cause la redondance de no btl

ce sera la caracteristique des cellules oranges